指挥官加点一个基础但至关重要的体系，指挥官更新后会获取未分配属性点，这些点数可以自在分配到四大基本属性上，分别是武器掌控、防御操作、电子工程和飞船驾驶，每个属性都会直接影响舰船的核心性能，武器掌控提高全部武器的伤害，防御操作增加护盾上限，电子工程进步能量上限，飞船驾驶则让舰船速度更快，初期加点时提议优先思考攻击和防御属性的平衡，由于单纯堆叠壹个路线在实战中容易遇到续航或生存难题。

属性点的分配还会解开对应领域的细分技能，比如在武器掌控属性达到一定数值后就能进修更顶级的磁轨炮、粒子炮、激光炮或导弹技能，这些技能可以进一步提高特定武器的伤害、射程和暴击率，防御操作下的技能则能加强护盾的抗性以及回充装置效果，电子工程关联能耗和能量恢复，飞船驾驶则影响航行速度和信号半径，因此加点不仅是为了属性本身的提高，更是为了开始更强大的技能树。

对于新人玩家来说相对稳妥的加点是满攻半盾路线，也就是将主要点数投入到武器掌控中，同时分配一部分到防御操作，这样既能保证输出能力又不会过于脆弱，电子工程和飞船驾驶可以适当点一些来改善能量管理和机动性，完全不点防御或全点速度虽然在某些方法中有奇效，但通常需要队友配合或特定战略支持，不适合个人尝试日常任务。

指挥官在创建人物时需要选择职业，不同职业的初始属性会有微小差异，比如军人职业初始攻击较高，科学家侧重护盾，工程师和探险家分别偏给能量和速度，但这些初始差异并不决定最终走给，真正影响人物进步路线的是后续的加点选择，如果对已经分配的属性不满意，游戏也提供了洗点功能，可以通过道具重置全部属性点和技能。