地牢里主要有黄金宝箱和环境宝箱两大类宝箱。黄金宝箱分布在地牢各处房间里，需要用黄金钥匙打开，而环境宝箱则包括神圣、丛林、冰雪、腐化或血腥等类型，它们外观颜色鲜明，需要对应的环境钥匙才能开始。寻找地牢宝箱前，需要先进入地牢。地牢入口通常在地图边缘，白天那里的老人无法对话，必须在晚上和他交谈来解除诅咒并召唤骷髅王，击败骷髅王后你才能安全进入地牢进行寻觅。地牢结构复杂，分支众多，寻觅时提议带上充足的火把等照明工具以及回血药水，并注意地面也许隐藏着尖刺陷阱，用平台铺路通过会更安全。

地牢中分布的黄金宝箱是早期的重要目标，开始它们可以获取如钴蓝盾、魔法导弹等有价格的物品。黄金钥匙主要通过击杀地牢中的怪物随机掉落，其中地牢史莱姆被击败时必定会掉落一把黄金钥匙。在地牢中遇到地牢史莱姆千万不要放过。

环境宝箱，它们共有五种，对应不同生态区域，如淡蓝色的神圣宝箱、紫色的腐化宝箱等。这些宝箱在击败世纪之花进入游戏后期后才能打开。开始它们需要对应的环境钥匙，而钥匙无法直接找到，必须在秘银砧或山铜砧处合成制作。

合成一把环境钥匙需要收集多种材料，决定因素材料其中一个是环境模具，例如神圣模具或丛林模具，它需要你在肉山后的全球，前往对应的生态环境区域大量刷怪才有概率获取。你还需要击败世纪之花获取一把神庙钥匙，以及击败机械三王收集力量之魂、视野之魂和恐惧之魂各5个。当合成好钥匙后，在地牢中找到对应颜色的环境宝箱，直接点击即可自动消耗钥匙开始宝箱，从中获取彩虹枪、腐化灾兵、食人鱼枪等强力的唯一武器。